公安機關向有關單位和個人調取實物證據，應當經縣級以上公安機關負責人批準，開具調取證據通知書。在接到調取證據通知書后，被調取單位、個人應當在通知書上蓋章或簽名，拒絕蓋章或簽名的，公安機關應當注明。公安機關向有關單位收集、調取的書面證據材料，必須由提供人簽名，并加蓋單位印章；公安機關向個人收集、調取的書面證據材料，必須由本人確認無誤后簽名或蓋章。檢察機關可以憑人民檢察院的證明文件，向有關單位和個人調取能夠證實犯罪嫌疑人有罪或者無罪的證據材料，并且可以根據需要拍照、錄像、復印和復制。對于涉及國家秘密的證據，應當嚴格保密。
一、不配合組織調查的處理如下：
1、由監督檢查部門責令改正，對個人可以處五千元以下的罰款，對單位可以處五萬元以下的罰款，并可以由公安機關依法給予治安管理處罰；
2、由反壟斷執法機構責令改正，對個人可以處二萬元以下的罰款，對單位可以處二十萬元以下的罰款；
3、情節嚴重的，對個人處二萬元以上十萬元以下的罰款，對單位處二十萬元以上一百萬元以下的罰款；
4、構成犯罪的，依法追究刑事責任。商請當事人所在單位或者違法行為發生地所在基層組織協助調查；
5、向上一級國土資源主管部門和本級人民政府報告；提請公安機關、檢察機關、監察機關或者相關部門協助；向社會通報違法信息。
二、公安調查取證的6種方法如下：
1、自行取證或委托律師調查取證。企業自身當然最為了解其自由的商業秘密的有關情況，例如企業自身所想要保護的信息的秘密點，因此企業自身最為取證這無可厚非，但由于商業秘密案件對證據的要求較高，對于取證的范圍和方式等企業可能無法較好的把握，故企業可以選擇聘請專業的律師來幫助完成取證工作；
2、公證機關進行公證保全。公證取證就是以公證機關的公信力，將權利人取證的過程記錄下來，將取得的證據封存在公證機關，在訴訟時提交法庭，作為訴訟的證據；
3、向法院申請證據保全。在證據可能滅失或者以后難以取得的情況下，訴訟參加人可以向人民法院申請保全證據。提出訴前證據保全申請，應當以書面形式，且一般應在舉證期限屆滿前提出；
4、申請法院調查取證；
5、向工商行政機關申請調查取證。商業秘密權利人發現商業秘密被侵犯時，可以根據規定向各級工商行政管理機關申請查處；
6、通過公安機關調查取證。公安機關是我國法定的偵查案件的機關，擁有強大的偵查力量體、先進的技術設備，豐富的偵查經驗，國家賦予其偵查權力。
【法律依據】：
《中華人民共和國刑事訴訟法》
第五十二條
審判人員、檢察人員、偵查人員必須依照法定程序，收集能夠證實犯罪嫌疑人、被告人有罪或者無罪、犯罪情節輕重的各種證據。嚴禁刑訊逼供和以威脅、引誘、欺騙以及其他非法方法收集證據，不得強迫任何人證實自己有罪。必須保證一切與案件有關或者了解案情的公民，有客觀地充分地提供證據的條件，除特殊情況外，可以吸收他們協助調查。
第五十四條
人民法院、人民檢察院和公安機關有權向有關單位和個人收集、調取證據。有關單位和個人應當如實提供證據。
行政機關在行政執法和查辦案件過程中收集的物證、書證、視聽資料、電子數據等證據材料，在刑事訴訟中可以作為證據使用。
對涉及國家秘密、商業秘密、個人隱私的證據，應當保密。
凡是偽造證據、隱匿證據或者毀滅證據的，無論屬于何方，必須受法律追究。