強奸案件中的立案證據一般主要有以下幾種：

1、被害人陳述。被害人所作的陳述，是證明強奸行為存在的直接證據。立案的條件需要有犯罪事實，被害人的陳述是證明犯罪事實存在的證據。

2、犯罪嫌疑人供述、辯解。立案的條件需要有犯罪嫌疑人，犯罪嫌疑人為直接主體，其證據較為直觀。

3、發現場遺留的物證：如或可證明有性行為發生的場物品類證據，如 遺留有嫌疑人、受害人精斑、血跡、毛發或者體液混合物的避孕套、床單、被套、枕巾、枕套、紙巾等物品，這類物證一般需要結合鑒定結論予以印證。

4、受害人可能遭受暴力的物品類證據，如被撕扯破的衣物、衣扣等;遺留的刀具、棍棒等兇器等。

5、受害人可能遭受性侵害且遺留有加害人體液的內褲、衣服、衛生巾等物品。

6、現場遺留的飲料、水杯、針管、針劑或者酒瓶、酒杯中等其他物證。如在麻醉類強奸案件中，存在加害人在飲料中添加春藥、麻醉劑的現象，此類物證也 需要結合鑒定結論等其他證據予以印證。

擴展資料：

根據《中華人民共和國刑法》第二百三十六條：

【強奸罪】以暴力、脅迫或者其他手段強奸婦女的，處三年以上十年以下有期徒刑。

奸淫不滿十四周歲的幼女的，以強奸論，從重處罰。

強奸婦女、奸淫幼女，有下列情形之一的，處十年以上有期徒刑、無期徒刑或者死刑：

(一)強奸婦女、奸淫幼女情節惡劣的;

(二)強奸婦女、奸淫幼女多人的;

(三)在公共場所當眾強奸婦女的;

(四)二人以上輪奸的;

(五)致使被害人重傷、死亡或者造成其他嚴重后果的。

第二百三十七條：

【強制猥褻、侮辱罪】以暴力、脅迫或者其他方法強制猥褻他人或者侮辱婦女的，處五年以下有期徒刑或者拘役。

聚眾或者在公共場所當眾犯前款罪的，或者有其他惡劣情節的，處五年以上有期徒刑。

【猥褻兒童罪】猥褻兒童的，依照前兩款的規定從重處罰。

相關案例：

1991年出生的高某是出租車司機，平時喜歡上網聊天。一次偶然的機會，高某和在校女生小麗（化名）成為QQ好友，后來兩人相約見面，并在賓館發生了關系。

然而，高某近日卻被邵陽市雙清區法院以強奸罪判處有期徒刑二年，緩刑二年。2012年10月15日凌晨2點左右，高某開著出租車在邵陽市區拉客，見路上行人稀少、生意清淡，他就進入網吧上網。

此時，他的QQ好友大都己睡覺，高某就設置搜索條件，看到照片靚麗的女孩就加人家的QQ號碼。加了幾個之后，竟有一女孩接受了他的好友請求，兩人一直聊到天亮。

而后，兩人天天在網上聊天，感情迅速升溫，談起了男女朋友。2012年10月20日凌晨，高某和小麗又在網上聊天，小麗約高某到另一網吧見面，見面后兩人手牽手在街上散步。

然后高某將小麗帶到一賓館開房，兩人在賓館發生了性關系。后兩人在該房間玩耍聊天，交談中高某得知小麗未滿14周歲，系在校學生。

高某在明知小麗未滿14周歲的情況下和她又發生了第二次性關系，當天下午離開該賓館。事情發生后小麗行為異常，父母逼問她才說出實情。

案發后，高某的父母和被害人小麗的父母達成和解協議，小麗及父母懇求政法部門對被告人高某免于刑事處罰。法院認為，高某奸淫未滿十四周歲的幼女，其行為已構成強奸罪。

案發后高某主動到公安機關投案，如實供述自己的罪行，系自首，依法對其減輕處罰。鑒于被告人高某和被害人小麗系自由戀愛關系，案發后雙方父母自愿達成民事和解、刑事諒解，法院遂作出前述判決。

參考資料來源：人民網-與未滿14周歲女友發生性關系 男子被判強奸罪